Pro minifikaci CSS existuje řada nástrojů (např. YUI Compressor), nejraději však používám klasické PHP:
$regex = array(
"`^([\t\s]+)`ism" => '',
"`([:;}{]{1})([\t\s]+)(\S)`ism" => '$1$3',
"`(\S)([\t\s]+)([:;}{]{1})`ism" => '$1$3',
"`\/\*(.+?)\*\/`ism" => "",
"`([\n|\A|;]+)\s//(.+?)[\n\r]`ism" => "$1\n",
"`(^[\r\n]*|[\r\n]+)[\s\t]*[\r\n]+`ism" => "\n"
);
$css = preg_replace(array_keys($regex), $regex, file_get_contents(__DIR__ . '/style.css'));
file_put_contents(__DIR__ . '/style.min.css', $css);